Visual OMP™を用いることで、分子ビーコンやアレル特異的分子ビーコンペアを両方デザインすることが可能です。 ループ構造やステム構造のサイズ、融解温度、および自由エネルギー変化がビーコンの特異性および感度向上のために最適化されます。 ビーコンのステム構造は近接する配列に誤って結合して消光することを防止するようにデザインされ、ステム構造末端のG/Cペアの数は必要なスペックにあわせて最適化可能です。