化合物結合サイト探索ソフト Ixchel

IxchelはMind the Byte社の従量課金型SaaSプラットフォームに組み込まれた計算科学的アプローチによる薬剤探索のためのタンパク質ベースの生物学的活性予測ツールです。このソフトウェアでは、ユーザーが入力する化合物(SDFまたはSMILEファイル)に関して、ライブラリに含まれる9,000以上の種類のタンパク質上のキャビティに対して結合する際の計算を行います。得られた結果はタンパク質-リガンド間の結合エネルギーに従って分類されます。このプログラムでは分子同士の比較から活性を外挿するのではなく、分子とタンパク質の相互作用を直接的に計算します。


インプット

低分子化合物


使用アルゴリズム

9,000のキャビティで構成されるデータベースに対するドッキング


アウトプット

ドッキングの結果得られた結合エネルギーが低いキャビティを持つタンパク質のリスト


HPC


用途

· 対象化合物のターゲット(タンパク質)の予測

· 薬剤の新規プロファイル(リポジショニング)

· 作用機序解明

· ADME/Toxに関するサポート


Mind the Byte社の最新情報はこちら: