SaaSコンサルテーションサービス

Mind the Byte社では革新的なSaaSプラットフォームの提供だけでなく、バイオテクノロジーおよび製薬企業、研究所や大学向けにカスタムの計算科学サービスを提供しています。

同社は過去数年間、Amazon Web Serverを技術パートナーとして最も高度なセキュリティ基準に準拠しながらクラウドコンピューティングの分野でサービスを提供してきました。この成果として、同社ではパワフルで簡単な契約で利用可能であり、小規模から大規模まで様々なスケールで実施可能な計算ソフトウェアを多額の投資を必要とせず利用可能にしました。


バーチャルプロファイリング


化合物の生物学的活性(ターゲットタンパク質、細胞および生物を含む)の計算科学的予測。プロファイリングによって作用機序の解明や薬剤の安定性やリガンド-ターゲット間の結合の安定性、副作用/毒性を評価することが可能になります。


バーチャルライブラリの多様化


ライブラリ構成化合物に類似のまたは生物学的同等性を持つ化合物の探索のためのコンピュータツール。


分子モデリング

ドッキング(相互作用の研究)や分子ダイナミクス(システムの挙動の研究)およびホモロジーモデリング(タンパク質3次元構造の予測)。


メディシナルケミストリー


新規分子のデザインとバリデーション。


カスタムプロジェクト

Mind the Byte社では上記以外にも、お客様各々のニーズに合致した、計算科学を駆使した薬剤開発に関する総合的なサービスを提供しております。すべてのインフラストラクチャーは同社が保持し、維持しておりますので、お客様にはインフラストラクチャーに関して労力を使う必要がありません。


化合物に対するターゲットの同定


ターゲットに対するリガンドの同定


対象化合物に呈する類似化合物の探索

アプリケーションソフト

Mind the Byte社のプラットフォームを構成するアプリケーションソフトは、インプットおよびアウトプットの種類、解析の内容によって8種類に分類されます。また、アプリケーションで利用するための形式にフォーマットするためのデータベースソフトも提供しております。


アプリケーション名 インプット アルゴリズム アウトプット HPC
Hurakan 低分子 ChEMBLデータベースとの3次元比較 ご指定の化合物に結合する候補タンパク質のリスト
Ik 低分子 ChEMBLデータベースとの3次元比較 ご指定の化合物に合致する低分子化合物リスト
Cabrakan 低分子 ChEMBLデータベースとの2次元比較 ご指定の化合物に結合する候補タンパク質のリスト -
Chaac 低分子 ご選択頂いたデータベースとの2次元比較 ご指定の条件に合致する低分子化合物のリスト -
Ixchel 低分子 9,000のキャビティで構成されるデータベースに対するドッキング ドッキングの結果得られた結合エネルギーが低いキャビティを持つタンパク質のリスト
Itzamna タンパク質 低分子化合物データベースに対するドッキング ご指定のタンパク質に結合する低分子化合物のリスト
Kizin タンパク質+活性 ChEMBLデータベースを用いて指定の活性を持つシード化合物のリストを生成し、当該リストをご指定の低分子化合物データベースと2次元比較しスクリーニングを行う 低分子化合物のリスト -
Kin タンパク質+低分子 ご指定の低分子化合物の、ご指定のタンパク質に存在するキャビティに対するドッキング 結合サイトのリスト
Ixtab データベース お客様のデータベースをプラットフォームで使用可能なフォーマットとしてアップロード アプリケーションで独自のデータベースを使用する際に利用 -

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