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標準的なPEPPerCHIP™ マイクロアレイにはHA およびFLAG タグ由来のペプチドが、分析対象となるメインの部分を取り囲むような配置でコントロールとして配置されています。PEPperCHIP™ 染色キットは、これらコントロールペプチドの染色に最適な抗体をCy4/Cy5 またはDyLight680/DyLight800で標識したものを含んだキットです。

PEPPerPrint社が提供するカスタムマイクロアレイのご紹介です。

PEPperCHIP™ ヒトエピトームマイクロアレイはImmune Epitope Database に含まれるすべての線形B 細胞エピトープをカバーしています。

PEPperCHIP™ トレーニングキットはPEPperCHIP™ マイクロアレイの取り扱い、アッセイの準備と実施、データの取得・定量化と評価にわたるまで様々な作業に関するトレーニングに必要なマイクロアレイや試薬を全て含んだオールインワンキットです。

PEPperCHIP™環状ペプチドマイクロアレイはPEPperPrint社のPEPperCHIP™プラットフォーム柔軟性を活用し、環状ペプチドをチップ上で同時並行的に合成します。抗原由来のPEPperCHIP™環状ペプチドマイクロアレイを用いることでモノクローナル抗体のコンフォメーションエピトープの高分解能マッピングが可能になります。

非侵襲的方法による診断が可能になる重大な疾病の早期バイオマーカーの同定は重要であり、また必要とされています。ハイコンテントペプチドマイクロアレイは血清または血漿中の抗体を利用したバイオマーカー探索のために非常に有用なツールです。PEPperCHIP™プラットフォームを利用することによって30,000以上の候補ペプチドから最終的には10以下まで段階的に絞り込むことが可能です。

ターゲット分子に結合するペプチドバインダーの開発において、ペプチドマイクロアレイはペプチドディスプレイ(mRNAディスプレイ、ファージディスプレイ、CISディスプレイ等）によるスクリーニングを補完するために最適の方法です。10^13程度までのペプチドを含むディスプレイライブラリを用いたスクリーニングは、引き続き行われる最適化前の出発配列の同定に最適です。

ペプチド置換スキャンサービスには線形ペプチドを使用する場合とコンフォメーションペプチドを使用する場合の2種類、一度に１部位のアミノ酸を置換するシングル置換と一度に２部位のアミノ酸を置換するダブル置換の２種類の組み合わせ、合計４種類のサービスがラインナップされています。

ペプチドマイクロアレイはキナーゼの基質となるペプチド配列の最適化にも有用です。使用するアレイではリン酸化サイト周辺のアミノ酸残基の1 残基置換スキャンを行っており、ATP の存在下でチロシンキナーゼまたはセリン/スレオニンキナーゼとインキュベートします。リン酸化されたチロシン、セリンまたはスレオニンは蛍光ラベルされたタグで染色されます。元の配列より強くまたは弱くリン酸化される配列が同定されます。

免疫モニタリングは動物免疫、ワクチン接種および生物学的製剤の投与によって引き起こされる抗体反応のフィンガープリント解析に有用です。抗原に対して反応する抗体の有無のみがわかるELISAとは異なり、PEPperMAP™免疫モニタリングサービスでは液性免疫を引き起こすエピトープの相対的免疫原性を評価することも可能です。

PEPperCHIP™ヒトエピトームマイクロアレイはImmune Epitope Databaseに含まれる線形B細胞エピトープをカバーする29,128種類の異なったペプチド含んでいます。これにより、このマイクロアレイは、何千種類もの異なった抗原由来ペプチドに対する抗体の反応を観測するのに最適なツールとなります。

PEPperCHIP™ ペプチドマイクロアレイは抗原の同定およびエピトープ探索のための最も経済的なツールです。PEPperCHIP™ ディスカバリーマイクロアレイ上には一度に多数のペプチドを配置することが可能であり、300以上の抗原由来のオーバーラッピングペプチドをアレイ上に配置できます。

PEPperCHIP™ペプチドマイクロアレイを用いることで高密度にペプチドを配置することが出来ます。これによって、複数種類の抗原由来の1残基オフセットオーバーラッピングペプチドを1 枚のマイクロアレイ上に合成することが可能となり、複数のマイクロアレイを用いる場合と比較し、アレイおよび試薬コストの削減およびアッセイ時間の短縮が可能になります。

PEPperPrint社では自己免疫疾患研究に対し、患者サンプルを用いた自己抗体のプロファイリングをはじめとする様々なソリューションを提供しています。

コンフォメーションエピトープ置換スキャンは、コンフォメーションエピトープを模倣した環状ペプチドの各位置のアミノ酸残基を順々に標準アミノ酸20種類およびその他の非標準アミノ酸や非天然アミノ酸で置換したペプチドを用いて実施します。

独自の技術で迅速かつ安価にペプチドマイクロアレイおよびこれを利用したサービスを提供しているPEPperPRINT社のご紹介です。

PEPperPRINT社の製品・サービスのアプリケーション例です。

PEPperPrint 社では、同社のPEPperCHIP™ テクノロジーと同社内で蓄積された経験やノウハウを利用し、PEPperMAP™ ペプチドマイクロアレイアッセイサービスを提供しております。

PEPperPrint 社の誇るPEPperCHIP™テクノロジーは、ペプチドを合成後スポッターやリソグラフィーで基盤に結合する通常の方法とは異なり、24 色のレーザープリンターを利用して特殊なコーティングを施したガラス基板上に直接ペプチドを合成します。ペプチド鎖の伸長はFmoc法を使用します。

PepSlide™ アナライザーはPEPperCHIP™ マイクロアレイの解析に最適化されたソフトウェアであり、得られた画像ファイルの解析やマイクロアレイデータの定量化のサポートの他、統計的なデータマイニングも実行可能です。

PEPperCHIP™ ヒトエピトームマイクロアレイを用い、抗c-Mycヒトモノクローナル抗体(chi9E10)の交差反応性試験が実施した例をご紹介しております。

PEPPerPrint社が提供する製品を用いて非常に簡便にがん研究のアッセイを行うことが可能です。

長期間にわたるマイクロ粒子および内包アミノ酸の安定性によって、PEPperCHIP™テクノロジーを利用すると必要な試薬の量が減少し、他の方法を利用したマイクロアレイの作製と比較すると飛躍的なコストの低減が可能になります。

アレルゲンタンパク質エピトープマイクロアレイによるIgE反応検出を行った例をご紹介しております。

PEPerCHIP™ インキュベーショントレイを使用することによって、PEPperCHIP™ マイクロアレイ１枚あたり複数のアッセイを独立に実行することが可能になります。

抗体医薬Rituximabは抗CD20モノクローナル抗体であり、CD20の細胞外ドメインをターゲットとしています。結晶構造解析の結果によると、RituximabはCD20の細胞外ドメインのループ部分に存在する15アミノ酸残基の配列NIYNCEPANPSEKNSPSTQYCYSIQと相互作用します。真のコアとなるエピトープを同定するため、当該配列に基づいてデザインされたオーバーラッピングペプチドを配置したコンフォメーションエピトープマイクロアレイを作製しエピトープマッピングの結果として、コンセンサス配列を得る例をご紹介しております。

抗CD20モノクローナル抗体である、抗体医薬Rituximabのコンフォメーションエピトープの同定を例に解説を行っております。

コンフォメーションペプチド置換スキャンは、コンフォメーションエピトープを模倣した環状ペプチドの各位置のアミノ酸残基を順々に標準アミノ酸20種類およびその他の非標準アミノ酸や非天然アミノ酸で置換したペプチドを用いて実施します。

ペプチド置換スキャンサービスには線形ペプチドを使用する場合とコンフォメーションペプチドを使用する場合の2種類、一度に１部位のアミノ酸を置換するシングル置換と一度に２部位のアミノ酸を置換するダブル置換の２種類の組み合わせ、合計４種類のサービスがラインナップされています。

非特異的なタンパク質/ ペプチドとスライド表面との相互作用のため、マイクロアレイのパフォーマンスおよびこれを用いたアッセイの感度はスライドの表面処理に大きく依存します。PEPperPrint社の技術者達は性能が不十分である既存の製品を利用せず、アッセイの品質およびデータの再現性を担保することが可能になる独自の表面コーティング技術を開発しました。

PEPPerPrint社が提供する製品を用いて非常に簡便にバインダー探索を行うことが可能です。

PEPperPrint 社では、同社のPEPperCHIP™ テクノロジーを用いたPEPperCHIP™ マイクロアレイ製品群のほか、カスタムマイクロアレイの作製やマイクロアレイを用いたアッセイのためのツールを提供しております。

PEPperCHIP™ プラットフォームを活用することによって、ペプチド医薬の開発のために標準アミノ酸や非標準アミノ酸のみでなく、修飾アミノ酸や非天然アミノ酸を含むコンビナトリアルペプチドライブラリを作製し、ターゲットとの相互作用によってスクリーニングを行うことが可能です。

PEPperCHIP™テクノロジーで使用されるレーザープリンターはPEPLASER FP7-HEALTH プロジェクトを通じて開発されたものです。基本的な機構は通常のレーザープリンターと同様ですが、スライドのアラインメントを行うための光学系や、繰り返しの合成を狂いなく行うためのステージや精密制御装置が備わっています。また、通常の4 色や6 色のプリンターと異なり、20 種類の標準アミノ酸およびD-アミノ酸やシトルリン、その他の非標準および非天然アミノ酸を使用出来るように24 のプリンティングユニットを有しています。プリンターの基礎部分は単一のブロックで構成されており、振動や熱による変動等に起因して生じる合成上の不正確さを防止します。

PEPperPrint社では製品およびサービスを最高の品質基準で提供するため、ISO 9001:2008 の認証を取得しています。品質管理システムのバリデーションを行い、認証を継続するため、毎年社内外の監査を実施しています。また、独自に継続的な品質改良を重ねています。。

PEPPerPrint社が提供する製品を用いて非常に簡便に感染症研究のアッセイを行うことが可能です。

PEPperCHIP™ 感染症エピトープマイクロアレイを用い、一度に多数の病原体感染を確認した例をご紹介しております。

線形エピトープと環状エピトープによるエピトープマッピングの結果を比較します。

ペプチドシングル置換スキャンでは、エピトープやペプチドターゲットバインダー等の各位置のアミノ酸残基を順々に標準アミノ酸や非標準アミノ酸、非天然アミノ酸で置換します。

順々にアミノ酸残基を置換するシングルスキャンと異なり、ダブルスキャンでは同時に2か所のアミノ酸残基を置換することによってエピトープの変異体やミモトープのハイスループットスクリーニングを行うことが可能です。ダブルスキャンではディスカバリーフォーマットを使用します。

PEPperCHIP™ マイクロアレイを利用したエピトープマッピングを行い、自己抗体のキャラクタリゼーションを実施した例をご紹介しております。

PEPPerPrint社が提供する製品を用いて非常に簡便に自己免疫研究のアッセイを行うことが可能です。

PEPperCHIP™ 自己エピトームマイクロアレイ2.0を用い、1型糖尿病患者血清中の自己抗体のスクリーニングを行った例をご紹介しております。

PEPperCHIP™ ペプチドマイクロアレイを用いることで、同等以下のコストで1 残基オフセットオーバーラッピングペプチドを1枚のマイクロアレイ上に合成し、エピトープマッピングを行うことが可能です。