特徴
- 初期投資不要
- 維持費不要
- 扱いやすいソフトウェア
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利用分野
- 化合物に対するターゲットの探索
- ターゲットに対するシード化合物の同定
- 対象化合物に類似する化合物の同定
- 活性化合物のスクリーニング
- 化合物ライブラリの管理
- リガンド-ターゲット間相互作用の研究
医薬品開発における用途例
医薬品開発の各段階で、以下のような様々な用途があります。
化合物に対するターゲットの同定
ターゲットに対するリガンドの同定
対象化合物に対する類似化合物の探索
アプリケーションソフト
Mind the Byte社のプラットフォームを構成するアプリケーションソフトは、インプットおよびアウトプットの種類、解析の内容によって8種類に分類されます。また、アプリケーションで利用するための形式にフォーマットするためのデータベースソフトも提供しております。
| アプリケーション名 | インプット | アルゴリズム | アウトプット | HPC |
|---|---|---|---|---|
| Hurakan | 低分子 | ChEMBLデータベースとの3次元比較 | ご指定の化合物に結合する候補タンパク質のリスト | ○ |
| Ik | 低分子 | ChEMBLデータベースとの3次元比較 | ご指定の化合物に合致する低分子化合物リスト | ○ |
| Cabrakan | 低分子 | ChEMBLデータベースとの2次元比較 | ご指定の化合物に結合する候補タンパク質のリスト | - |
| Chaac | 低分子 | ご選択頂いたデータベースとの2次元比較 | ご指定の条件に合致する低分子化合物のリスト | - |
| Ixchel | 低分子 | 9.000のキャビティで構成されるデータベースに対するドッキング | ドッキングの結果得られた結合エネルギーが低いキャビティを持つタンパク質のリスト | ○ |
| Itzamna | タンパク質 | 低分子化合物データベースに対するドッキング | ご指定のタンパク質に結合する低分子化合物のリスト | ○ |
| Kizin | タンパク質＋活性 | ChEMBLデータベースを用いて指定の活性を持つシード化合物のリストを生成し、当該リストをご指定の低分子化合物データベースと2次元比較しスクリーニングを行う | 低分子化合物のリスト | - |
| Kin | タンパク質＋低分子 | ご指定の低分子化合物の、ご指定のタンパク質に存在するキャビティに対するドッキング | 結合サイトのリスト | ○ |
| Ixtab | データベース | お客様のデータベースをプラットフォームで使用可能なフォーマットとしてアップロード | アプリケーションで独自のデータベースを使用する際に利用 | - |
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SaaSプラットフォームページ一覧 ( 10 件 )
2D類似化合物探索ソフト Chaac
Mind the Byte社が提供する計算科学的アプローチによる薬剤探索のためのリガンドベースのバーチャルスクリーニングツールのご紹介です。
3Dターゲット探索ソフト Cabrakan
Mind the Byte社が提供する2次元のリガンドベースプロファイリングアプリCabrakanのご紹介です。
3Dリガンドプロファイリングソフト Hurakan
Mind the Byte社が提供する3次元のリガンドベースプロファイリングアプリのご紹介です。
3D類似化合物探索ソフト Ik
Mind the Byte社が提供する独自の3Dアルゴリズムを利用し、対象分子の比較対象分子との挙動を比較することができるバーチャルスクリーニングツールのご紹介です。
Saasプラットフォームの料金プラン
Mind the Byte社で提供しているソフトウェアは単に薬剤探索プロジェクトの迅速化のための最新のソフトウェアであるだけでなく、その提供価格に関しても１回の使用ごとの従量課金や計算回数の制限がないフラットプランからご選択頂けます。お客様側では他の科学ソフトウェアを購入する必要やサーバーの利用料や設定、メンテナンス等の費用が不要です。
ターゲット結合化合物探索ソフト Itzamna
Mind the Byte社が提供するドッキングテクノロジーを利用し、ターゲットに対する結合活性を持つ化合物を同定するためのソフトウェアのご紹介です。
データベースソフト Ixtab
Mind the Byte社が提供する化合物ライブラリ管理ツールのご紹介です。
化合物結合サイト探索ソフト Ixchel
Mind the Byte社が提供する計算科学的アプローチによる薬剤探索のためのタンパク質ベースの生物学的活性予測ツールのご紹介です。
活性化合物探索ソフト Kizin
Mind the Byte社が提供する化合物スクリーニングツールのご紹介です。
結合サイト探索ソフト Kin
Mind the Byte社が提供するブラインドドッキングテクノロジーを利用したソフトウェアのご紹介です。