特徴
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利用分野
- 化合物に対するターゲットの探索
- ターゲットに対するシード化合物の同定
- 対象化合物に類似する化合物の同定
- 活性化合物のスクリーニング
- 化合物ライブラリの管理
- リガンド-ターゲット間相互作用の研究
医薬品開発における用途例
医薬品開発の各段階で、以下のような様々な用途があります。
化合物に対するターゲットの同定
ターゲットに対するリガンドの同定
対象化合物に対する類似化合物の探索
アプリケーションソフト
Mind the
Byte社のプラットフォームを構成するアプリケーションソフトは、インプットおよびアウトプットの種類、解析の内容によって8種類に分類されます。また、アプリケーションで利用するための形式にフォーマットするためのデータベースソフトも提供しております。
| アプリケーション名 |
インプット |
アルゴリズム |
アウトプット |
HPC |
| Hurakan |
低分子 |
ChEMBLデータベースとの3次元比較 |
ご指定の化合物に結合する候補タンパク質のリスト |
○ |
| Ik |
低分子 |
ChEMBLデータベースとの3次元比較 |
ご指定の化合物に合致する低分子化合物リスト |
○ |
| Cabrakan |
低分子 |
ChEMBLデータベースとの2次元比較 |
ご指定の化合物に結合する候補タンパク質のリスト |
- |
| Chaac |
低分子 |
ご選択頂いたデータベースとの2次元比較 |
ご指定の条件に合致する低分子化合物のリスト |
- |
| Ixchel |
低分子 |
9.000のキャビティで構成されるデータベースに対するドッキング |
ドッキングの結果得られた結合エネルギーが低いキャビティを持つタンパク質のリスト |
○ |
| Itzamna |
タンパク質 |
低分子化合物データベースに対するドッキング |
ご指定のタンパク質に結合する低分子化合物のリスト |
○ |
| Kizin |
タンパク質＋活性 |
ChEMBLデータベースを用いて指定の活性を持つシード化合物のリストを生成し、当該リストをご指定の低分子化合物データベースと2次元比較しスクリーニングを行う |
低分子化合物のリスト |
- |
| Kin |
タンパク質＋低分子 |
ご指定の低分子化合物の、ご指定のタンパク質に存在するキャビティに対するドッキング |
結合サイトのリスト |
○ |
| Ixtab |
データベース |
お客様のデータベースをプラットフォームで使用可能なフォーマットとしてアップロード |
アプリケーションで独自のデータベースを使用する際に利用 |
- |
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