PEPperPRINT社 サービス一覧

PEPperCHIP™環状ペプチドマイクロアレイはPEPperPrint社のPEPperCHIP™プラットフォーム柔軟性を活用し、環状ペプチドをチップ上で同時並行的に合成します。抗原由来のPEPperCHIP™環状ペプチドマイクロアレイを用いることでモノクローナル抗体のコンフォメーションエピトープの高分解能マッピングが可能になります。

非侵襲的方法による診断が可能になる重大な疾病の早期バイオマーカーの同定は重要であり、また必要とされています。ハイコンテントペプチドマイクロアレイは血清または血漿中の抗体を利用したバイオマーカー探索のために非常に有用なツールです。PEPperCHIP™プラットフォームを利用することによって30,000以上の候補ペプチドから最終的には10以下まで段階的に絞り込むことが可能です。

ターゲット分子に結合するペプチドバインダーの開発において、ペプチドマイクロアレイはペプチドディスプレイ(mRNAディスプレイ、ファージディスプレイ、CISディスプレイ等）によるスクリーニングを補完するために最適の方法です。10^13程度までのペプチドを含むディスプレイライブラリを用いたスクリーニングは、引き続き行われる最適化前の出発配列の同定に最適です。

ペプチド置換スキャンサービスには線形ペプチドを使用する場合とコンフォメーションペプチドを使用する場合の2種類、一度に１部位のアミノ酸を置換するシングル置換と一度に２部位のアミノ酸を置換するダブル置換の２種類の組み合わせ、合計４種類のサービスがラインナップされています。

ペプチドマイクロアレイはキナーゼの基質となるペプチド配列の最適化にも有用です。使用するアレイではリン酸化サイト周辺のアミノ酸残基の1 残基置換スキャンを行っており、ATP の存在下でチロシンキナーゼまたはセリン/スレオニンキナーゼとインキュベートします。リン酸化されたチロシン、セリンまたはスレオニンは蛍光ラベルされたタグで染色されます。元の配列より強くまたは弱くリン酸化される配列が同定されます。

免疫モニタリングは動物免疫、ワクチン接種および生物学的製剤の投与によって引き起こされる抗体反応のフィンガープリント解析に有用です。抗原に対して反応する抗体の有無のみがわかるELISAとは異なり、PEPperMAP™免疫モニタリングサービスでは液性免疫を引き起こすエピトープの相対的免疫原性を評価することも可能です。

PEPperCHIP™ヒトエピトームマイクロアレイはImmune Epitope Databaseに含まれる線形B細胞エピトープをカバーする29,128種類の異なったペプチド含んでいます。これにより、このマイクロアレイは、何千種類もの異なった抗原由来ペプチドに対する抗体の反応を観測するのに最適なツールとなります。

PEPperCHIP™ ペプチドマイクロアレイは抗原の同定およびエピトープ探索のための最も経済的なツールです。PEPperCHIP™ ディスカバリーマイクロアレイ上には一度に多数のペプチドを配置することが可能であり、300以上の抗原由来のオーバーラッピングペプチドをアレイ上に配置できます。

PEPperCHIP™ペプチドマイクロアレイを用いることで高密度にペプチドを配置することが出来ます。これによって、複数種類の抗原由来の1残基オフセットオーバーラッピングペプチドを1 枚のマイクロアレイ上に合成することが可能となり、複数のマイクロアレイを用いる場合と比較し、アレイおよび試薬コストの削減およびアッセイ時間の短縮が可能になります。

PEPperPrint社では自己免疫疾患研究に対し、患者サンプルを用いた自己抗体のプロファイリングをはじめとする様々なソリューションを提供しています。

コンフォメーションエピトープ置換スキャンは、コンフォメーションエピトープを模倣した環状ペプチドの各位置のアミノ酸残基を順々に標準アミノ酸20種類およびその他の非標準アミノ酸や非天然アミノ酸で置換したペプチドを用いて実施します。

コンフォメーションペプチド置換スキャンは、コンフォメーションエピトープを模倣した環状ペプチドの各位置のアミノ酸残基を順々に標準アミノ酸20種類およびその他の非標準アミノ酸や非天然アミノ酸で置換したペプチドを用いて実施します。

ペプチド置換スキャンサービスには線形ペプチドを使用する場合とコンフォメーションペプチドを使用する場合の2種類、一度に１部位のアミノ酸を置換するシングル置換と一度に２部位のアミノ酸を置換するダブル置換の２種類の組み合わせ、合計４種類のサービスがラインナップされています。

線形エピトープと環状エピトープによるエピトープマッピングの結果を比較します。

ペプチドシングル置換スキャンでは、エピトープやペプチドターゲットバインダー等の各位置のアミノ酸残基を順々に標準アミノ酸や非標準アミノ酸、非天然アミノ酸で置換します。

順々にアミノ酸残基を置換するシングルスキャンと異なり、ダブルスキャンでは同時に2か所のアミノ酸残基を置換することによってエピトープの変異体やミモトープのハイスループットスクリーニングを行うことが可能です。ダブルスキャンではディスカバリーフォーマットを使用します。

PEPperCHIP™ ペプチドマイクロアレイを用いることで、同等以下のコストで1 残基オフセットオーバーラッピングペプチドを1枚のマイクロアレイ上に合成し、エピトープマッピングを行うことが可能です。