PEPperMAP™ コンフォメーションペプチドシングル置換スキャンサービス
コンフォメーションペプチド置換スキャンは、コンフォメーションエピトープを模倣した環状ペプチドの各位置のアミノ酸残基を順々に標準アミノ酸20種類およびその他の非標準アミノ酸や非天然アミノ酸で置換したペプチドを用いて実施します。
アプリケーション
· エピトープ中の保存的および非保存的アミノ酸残基の同定
· 変異エピトープや新規ミモトープの探索
· 抗体の特異性や交差反応性の評価
· ペプチドワクチン開発
· ペプチドターゲットバインダーの開発
サンプル
血清10～20μLまたは精製ターゲット抗体/ タンパク質10～20μg
（タンパク質の場合ビオチン、FLAG、His、HAタグ等の付加またはターゲットタンパク質特異的抗体が必要です）
マイクロアレイ構成ペプチド
出発配列の各位置で1アミノ酸残基をそれ以外の19種類のアミノ酸で置換した配列を持つペプチドおよび元の配列から構成されるライブラリ
置換アミノ酸
標準では標準アミノ酸20種類。非標準アミノ酸や非天然アミノ酸も可能
ペプチド長
標準では13アミノ酸まで
変更も可能。最長20アミノ酸残基
スキャン対象モチーフペプチド長
標準では13アミノ酸まで。変更も可能
同一ペプチドの重複数
標準では2（変更も可能）
ペプチド環化手法
ジスルフィド結合形成またはチオエステル形成
コントロールペプチド
標準ではHA(YPYDVPDYAG)およびFLAG(DYKDDDDKAS)ペプチド（フレーム部位）
出発配列数
複数の出発配列由来のペプチドライブラリを同時に配置可能（例：15アミノ酸残基のペプチドを標準アミノ酸で置換する場合、約10種類。3重に配置する場合。）
分析
各サンプル毎にマイクロアレイを使用した分析の他、単一マイクロアレイを使用した複数サンプルの混合液とのインキュベーションや複数サンプルとの連続的なインキュベーションも可能。(特異的抗体や異なるタグ等によって抗体やターゲットタンパク質を識別することが可能な場合）
必要情報
ペプチド配列情報
納品物
アミノ酸プロット、置換マトリックス(
保存および非保存的アミノ酸残基情報を含む) を含むレポート